Začetki Šmarješkega teka segajo v leto 1995, takrat je bil tek namenjeni predvsem kvalitetnim tekačem, katerim so bile namenjene tudi denarne nagrade. Tek je potekal v organizaciji Zdravilišča Šmarješke Toplice, sedanjih Terme Krka in nekaj njenih zagnanih zaposlenih. Skozi leta sta pri organizaciji sodelovala športno in turistično društvo Šmarjeta oz. Šmarješke Toplice od podpori že omenjenih Term Krka in lokalnega podjetja Plastoform. Zadnja leta je v organizacijo močno vpeto društvo Marathon, nekateri člani so vlečna sila teka že od samih začetkov. Prireditev je približana široki množici rekreativcev z velikim poudarkom na spremljevalnih dejavnostih ter animacijah za otroke in mladino.

Velik magnet je vedno kopanje v zunanjih bazenih, ki je vključeno v startnino za vse udeležence. Idej organizatorjem ne zmanjka, zato lahko z zanimanjem vsako leto ugotovimo, da v Šmarjeških Toplicah ni nikoli dolgčas.